Entwicklung einer universellen DNA-basierten Array-Plattform zur verbesserten Tumorklassifizierung am Beispiel des diffus großzelligen B-Zell-Lymphoms (DLBCL)
Berichte aus Forschung und Entwicklung IGB, Band 59
Sonja Ulrike Weishaupt
Hrsg.: Fraunhofer IGB, Stuttgart
2014, 184 S., zahlr., teils farb. Abb. u. Tab., Softcover
Stuttgart, Univ., Diss., 2014
Fraunhofer Verlag
ISBN 978-3-8396-0707-7

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Inhalt
Eine exakte Diagnose von extrem heterogenen Tumorarten basiert grundlegend auf deren eindeutiger Klassifizierung. In solchen Fällen besitzt eine Tumorcharakterisierung auf der Basis mehrerer molekularer Parameter das Potenzial für eine differenzierte Klassifizierung von Varianten und Subtypen. Im Rahmen dieser Dissertation wurde am Beispiel des diffus großzelligen B-Zell-Lymphoms (DLBCL) ein auf DNA basierender ZIP-Code-Microarray zur Analyse mehrerer molekularer Parameter entwickelt. Auf DNA-Ebene konnte die Detektion von Einzelbasen-Polymorphismen in DLBCL für den ZIP-Code-Array mittels klinischer FFPE-Gewebeproben erfolgreich etabliert, optimiert und validiert werden. Zur Analyse der Genexpression für DLBCL erfolgte eine Methodenoptimierung für den DNA-basierten ZIP-Code-Array mittels humaner Zelllinien. Das besondere Interesse lag in der Etablierung der Detektion von microRNA mittels des ZIP-Code-Arrays. In dieser Arbeit wird erstmals eine Methode beschrieben, bei der eine Array-basierte, zeitgleiche spezifische Detektion und Differenzierung von reifer und Vorläufer-microRNA möglich ist.

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